1996年在柏林召開了第一屆Y-STR分型學術會議，統-了Y-STR的命名原則，建議用核心序列重復數命名STR等位基因，用小數點后的數表示不完整核心序列的堿基對數。隨著Y-STR研究和應用的迅速發展，ISFG于2001年公布了關于Y-STR的最新應用指導建議(Gill et a1．，2001)。目前有兩種基本格武，一是用“DYS***”表示，“D”代表DNA，“Y”代表Y染色體，“S”代表單一序列(single sequence)，“**-x”為STR的順序號，如“DYS390”、“DYS389I／Ⅱ”等；二是用“Y-核心重復序列”表示，核心重復序列相同時附加順序號，如 “Y-GATA-A10”、“YCAI/II/III”等。ISFG同時指出，對于已經廣泛采用的基因座，則繼續采用已有的名稱，而對于新發現的基因座，建議采用“DYS***”系統命名。等位基因根據具有個體差異的包括簡單或復雜序列結構在內的完全重復次數命名，小數點后的數表示不完整核心序列的堿基對數。
Y-STR呈連鎖遺傳，不符合Hardy-Weinberg平衡定律，它們的累積個體識別率不能按常染色體STR基因座的乘法規則進行計算，其個體識別率的計算有特定的規則和公式。統計獲得的GD值和HD值（haplotype diversity，單倍型變異度）越大，說明該基因座或單倍型能提供的信息量越多，相應的法醫遺傳學應用價值越高。 對于Y染色體來說，GD值即等于PE值。對于群體樣本研究獲得的等位基因數據的分析，應用直接計數法計算各個基因座的等位墓因頻率和單倍型頻率。各個基因座的GD值和HD值，利用公式：GD/HD=n (1-∑Pi2)／(n-l)(Pi為等位基因頻率，n為樣本數)計算；標準誤(standard errors，SE)利用公式：SE-{2[∑Pi3-(∑Pi2)2／n}l／2 (Pi為等位基因頻率，n為樣本數)計算；對于不同群體之間數據的對比分析，采用卡方(X2)檢驗(Hou et a1．，2001)。更多詳情：www.qinzijianding.cn
